由于新生儿皮下坏疽起病突然，病变区蔓延迅速，所以早发现、早诊断、早治疗显得尤为重要。一般讲皮下坏疽最好能住院治疗，其中坏疽区超过体表面积5％、或者早产儿患皮下坏疽以及合并败血症者必须住院治疗。病情轻或者病变区有限局表现（此时患处像个脓包）者有时可先在急诊治疗。无论是住院还是急诊观察，都要注意病变区的变化，强调早期切开引流的重要性，传统的切开引流术认为必须在患处积脓后方可实施，否则容易引起患处出血和感染扩散，而新生儿皮下坏疽以皮下组织发生坏死为主要改变，早期病变区脓液量少，甚至只有一些血性渗液，若按传统概念等到有脓液积聚后才进行切开引流术，势必延误病情，且病变区已明显扩大。所以一旦发现病变区有软化漂浮区，即应及时切开引流，?K采用多个（每1％体表面积病变区至少一个切口）小切口技术充分引流，切口间塞入油纱条，即可以止刀口出血，又可以引导脓液外流，从而有力阻止病变区的蔓延。
切开引流后，坚持每日洗澡换药，一方面观察病变区有无扩大，另一方面对已切开的伤口要去除坏死组织、清理脓液、清洗病灶、更换已被脓液浸脏的敷料（包括油纱条纱布绷带等），以控制和促进切口及病变区愈合。对已坏死变黑的皮肤等组织加以切除，外敷药物，待宝宝病情平稳、创面好转时，对其中范围大者适时进行植皮手术。
抗生素的使用很重要，通常需要静点抗生素1周或更长的时间，一般先选用作用强的头孢菌素。脓培养结果出来后，可根据病原菌选用敏感的抗生素，如万古霉素、丁胺卡那霉素、头孢哌酮等。
由于皮下坏疽病变区较大；大量的坏死组织生成；发烧以及病后奶入量不足，给病儿身体造成了较大的损失，所以支持治疗必不可少。包括少量多次输新鲜血、输血浆、给予静脉高营养液及球蛋白等，不仅增加了病儿抗病能力，而且促进了病变区的康复。
其它如中药、加强喂养、高压氧舱等也可使用，总之，本病须早期治疗，?K采用综合治疗方法效果才比较满意。后期换药可在门急诊继续进行。
